Lembaga Jaminan Mutu UKIM adalah Lembaga di dalam Universitas Kristen Indonesia Maluku yang bertugas dan bertanggung jawab penuh untuk menyelenggarakan, mengelola, dan mengendalikan sistem penjaminan mutu internal (SPMI) di seluruh lingkup universitas. LJM adalah “penjaga kualitas” yang memastikan bahwa proses pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat di UKIM berjalan sesuai dengan standar yang ditetapkan.